Yli 200 jäsenvaltioiden edustajista koostuvaa työryhmää ja komiteaa valmistelee asiat pysyvien edustajien komitealle (Coreper II ja I).
Osalla komiteoista on erityinen tehtävä tarjota tietyn alan asiantuntemusta ja koordinointia. Tällainen on esimerkiksi vuonna 2000 perustettu poliittisten ja turvallisuusasioiden komitea (COPS), joka osallistuu unionin ulko- ja turvallisuuspolitiikan määrittelyyn. Sillä on myös tärkeä rooli EU:n kriisinhallintatehtävien johtamisessa ja valvonnassa.
Muita erityiskysymysten valmisteluun keskittyviä komiteoita ovat talous- ja rahoituskomitea (EFC), kauppapoliittinen komitea, oikeus- ja sisäasioiden artikla 36-komitea sekä maatalousneuvostoja valmisteleva maatalouden erityiskomitea.
Neuvoston työryhmissä ovat edustettuina kaikki jäsenvaltiot ja komissio. Kokouksiin osallistuu joko jäsenvaltion virkamies EU-edustustosta ja/tai virkamies pääkaupungista. Puheenjohtajana toimii kulloisenkin puheenjohtajavaltion edustaja.